尤里卡!在SIB(瑞士生物信息学研究所)用StorNext破解组学代码

SIB瑞士生物信息学研究所处于生命科学下一场伟大革命的最前沿——将计算方法应用于基因组学、蛋白质组学和其他生物信息学科学。SIB的工作越来越集中于应用基因组学来提高生活质量。

“SIB最近研究了一种产前诊断测试算法，用于诊断唐氏综合症等疾病，”Vital-IT集团的主管Ioannis Xenarios教授解释说。“从11周大的母亲身上抽取血液，我们就可以对子宫内胎儿的遗传物质进行排序。与传统的羊膜穿刺术相比，它的侵入性更小，风险也更小。这表明基因组学在我们的日常生活中变得越来越重要。”

每周超过30TB创造唯一的数据管理挑战

SIB运营着6个测序中心，支持大约300个研究团队，每周产生30TB的测序数据。

Vital-IT高级科学家和IT经理Roberto Fabbretti解释说:“在过去的几年里，测序变得越来越快。”“这意味着我们正在做比以往更多的项目，我们的数据增长非常迅速。”

长期研究需求数据管理

Xenarios说:“对于癌症和免疫治疗等领域的研究，我们为每位患者收集了大量的测序数据。”“如果这个人每周或每月回来，那么之前测试的所有数据都需要在短时间内快速准确地提供给研究人员。”为了使我们的生物信息学工作能够支持成千上万的患者，我们需要寻找具有成本效益的方法来保存20年、30年或40年的基因组数据——有效地创建一个患者从出生到死亡的视图。”

千兆级高性能存储

今天，Vital-IT使用来自Quantum的StorNext扩展存储支持其研究基础设施。研究人员通过四个独立的StorNext系统进行高速测序和分析——将近1PB的主存储和4PB的经济磁带档案。StorNext支持使用IP over Infiniband进行高性能处理，将活动数据保存在主存储上进行分析，并在文件老化时自动将文件移动到AEL磁带归档。超过600个用户在其中一个数据中心或通过CIFS接口远程访问数据。

自助式访问保留基因组学数据准备进行研究

Fabbretti说:“我们的研究人员捕获和分析的数据在今天提供了重要的答案，但当新的分析应用程序可以从相同的原始序列中提取信息时，它也有可能在几个月或几年之后变得有用。”“StorNext允许我们为所有项目提供成本效益高的长期存档，无论项目计划持续多久。”

归档文件仍然出现在研究人员期望它们在文件系统中的位置，因此它们可以在没有IT支持的情况下轻松地直接访问。

“如果您为研究人员提供了正确的工具，他们推动信封，”Xenarios说。“StorNext分层存储有助于我们快速获取数据，快速将其移至存档，并准备好准备好，因此生物信息管理员可以继续工作。”

自动保护地球上一些最有价值的数据集

“StorNext不仅帮助我们确保我们快速捕获数据 - 它还使归档自动化，具有成本效益的流程来帮助我们实现作为数据管家的角色，”Fabbretti说。“我们始终在磁带上进行两份文件副本，保留存档中的一个可用的文件，另一层用于任何类型的硬件故障或对网站的损坏提供额外的保护层。”

“我们正在处理地球上的一些最有价值的数据集，”Fabbretti解释道。“StorNext为我们提供了多宠物档案能力，长期数据保护，以及轻松回滚文件版本的能力 - 这是该策略的一个批判性重要的部分。”

可伸缩性使SIB为未来做好准备

“Stornext支持我们的增长超过六年。我们知道我们可以在需要时轻松添加更多磁盘和容量。事实上，我们已经超越了基因组学，可以存储和保护一般医学研究数据集。对我们来说，StorNext可以很容易地包括诸如展开时的存储工作流程中的云或对象存储等额外的层。“亚搏电竞app下载